在今天举行的中国科学院2006年度工作上，中科院常务副院长白春礼介绍了未来5年中科院科研攻关的主要方向和目标：在基础研究方面，量子结构与量子信息研究、纳米科技研究、强激光物理研究、脑与认知及神经科学研究、蛋白质与进化生物研究、人类与动植物基因组学和功能基因研究、核心数学研究及经济社会系统预测预报等进入世界先进行列。
在战略高技术方面，高性能通用芯片与专用芯片、万亿次超级计算机及服务器、新一代低成本个人计算机、高精度多频谱对地观测技术、全球和区域定位技术、功能小卫星、无线传感与网络技术、数字视音频标准、新药创制、煤清洁利用与转化技术、天然气转化技术、二氧化碳固定与利用技术、先进材料等实现重大突破，形成核心自主知识产权，支撑产业技术升级，培育新兴产业，满足国家安全重大需求。
在经济社会可持续发展研究方面，系统认知我国资源、环境、生态变化规律，为落实科学发展观提供决策依据。解决我国经济社会可持续发展相关重大科技问题，为资源节约与开发利用、生态保护与环境整洁、现代农业与区域可持续发展、重大自然灾害预警与长周期气候预报等提供新的方法、技术与手段。在营养、健康、重大疾病预防和生物安全等方面作出战略性贡献。
到2010年，中科院通过知识技术转移与成果转化，使社会企业形成销售收入达到1000亿元，实现利税100亿元。院所投资企业年营业收入达1700亿元，利润总额200亿元，为社会提供10万个以上就业机会。
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